.

MEB Özel Eğitim Rehberlik ve Danışma Hizmetleri Genel Müdürlüğünün 16.03.2006 gün ve B.08.0.örg.0.20.01.05.420/1166 sayılı Makam Onayı Zeytinburnu İlçesi Bozkurt İlköğretim Okulu ek binasında "Zeytinburnu Otistik Çocuklar Merkezi " adıyla açılan ancak eğitim öğretim faaliyetine geçemeyen okulumuz İstanbul Valiliğinin 10.10.2007  gün ve B.08.4.MEM.4.34.00.10-715 sayılı Makam Onayı ile Zeytinburnu İlçesi Merkezefendi İlköğretim Okuluna taşınmasına karar verilmiştir. Kurucu müdür olarak rehber öğretmen Volkan KUMAŞ atanmış ve İstanbul Valiliğinin 17.10.2007  gün ve B.08.4.MEM.4.34.00.10-715/796  sayılı yazısı ile konu İlköğretim Genel Müdürlüğüne konu intikal ettirilmiştir. İlköğretim Genel Müdürlüğü ilk olarak 21.11.2007  gün ve B.08.0.İGM.08.02.01-702.1/19232 sayılı yazısı ile red edilmiştir. Ardından 18.12.2007  gün ve B.08.0.İGM.08.02.01-702.1/20699 sayılı yazısı ile geçici tahsise izin verilmiştir. İnşaatı 2008 yılında tamamlanan okulumuz 2008/2009 eğitim öğretim yılının 2. Döneminde eğitim öğretime başlamıştır.

 MEB Özel Eğitim Rehberlik ve Danışma Hizmetleri Genel Müdürlüğünün 18.01.2012 gün ve B.08.0.ÖRG.0.20.00.00-105.01/264 sayılı Makam Onayı  ile "Zeytinburnu Otistik Çocuklar Merkezi" bünyesinde iş eğitim merkezi açılması ve okulun adının "Zeytinburnu Otistik Çocuklar Merkezi ve İş Eğitim Merkezi" olarak değiştirilmiştir.

Özel Eğitimde Zorunlu Eğitim Uygulamaları Kapsamında MEB Özel Eğitim Rehberlik ve Danışma Hizmetleri Genel Müdürlüğünün 02.08.2012 gün ve B.08.0.ÖRG.0.20.00.00-105.03/3021 sayılı Makam Onayı  ile okulun adı "Zeytinburnu Özel Eğitim Uygulama Okulu ve İş Eğitim Merkezi " olarak değiştirilmiştir. 

Son olarak 07.07.2018 tarih ve 30471 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan Özel Eğitim Hizmetleri Yönetmeliğinin 32. maddesi gereği okulumuzun adı "Zeytinburnu Özel Eğitim Uygulama Okulu (I. Kademe,II. Kademe ve III. Kademe)" olarak güncellenmiştir.